Organizační struktura je postavena tak, aby IFER dokázal především pružně reagovat na aktuální požadavky zadavatelů projektů. V rámci IFER vznikla během rozvoje firmy jednotlivá oddělení vytvářející vertikální strukturu, ta se kombinuje s horizontální strukturou vázanou na řešené projekty. Oddělení ale spíše reprezentují jednotlivá dlouhodobá odborná zaměření firmy, nepředstavují pevný rámec organizační struktury. Řešitelské týmy, vznikající při řešení konkrétních projektů, představují proměnlivou, ale klíčovou stránku organizační struktury. Sestavují se ke každému projektu zvlášť a jsou do nich vybíráni pracovníci průřezově z různých oddělení podle zaměření, které je potřebné k řešení daného projektu.
V čele IFER stojí statutární zástupce – jednatel společnosti, vnitřní chod společnosti řídí výkonná ředitelka.
Ing. Martin Černý, CSc.
Jednatel společnosti a hlavní architekt technologie Field-Map
RNDr. Jana Beranová
Výkonná ředitelka společnosti
doc. Ing. Emil Cienciala, Ph.D.
Vedoucí sekce Věda a výzkum
Ing. Bohumila Cerna
Vedoucí sekce ekonomika
Ing. Petr Blažek
Vedoucí sekce obchod a technická podpora, vývoj
Ing. Ondřej Černý
Vývoj a technická podpora
Ing. Martina Roubalová
Vývoj a instalace
Ing. Vladimír Zatloukal
Věda a výzkum
Bc. Šárka Holá
GIS
Ing. Jana Walterová
Ekonomika a obchod
Pavel Málek
Obchod a technická podpora
Vladislav Kopecký
Technik
Ing. Miroslav Michalec
Terénní měření
Mgr. Radka Mašková
Věda a výzkum
Ing. Tereza Fukalová
Obchod a technická podpora
Ing. Jorge Palmero Barrachina
Věda a výzkum