Těžiště aktivit IFER leží v oblasti lesnictví, a to na všech jeho úrovních – ať už je to lesnický provoz (lesní těžba, pěstování lesů atd.), hospodářská úprava lesa, monitoring chráněných území, lesnická politika, správa databází a vývoj SW pro lesnictví a mnoho dalších. Dlouhodobě se IFER také zabývá problematikou klimatické změny, a s tím souvisejícím monitoringem zásob uhlíku a inventurou emisí skleníkových plynů. V současnosti se IFER soustředí na vývoj a vytváření provozně uplatnitelných aplikací umožňujících průběžně aktualizovat data lesních hospodářských plánů a v neposlední řadě také na vývoj efektivních postupů pro zjišťování produkčních možností lesa.
Suma teoretických vědomostí i praktických zkušeností ze všech těchto oblastí umožnila Ústavu pro výzkum lesních ekosystémů dlouhodobý vývoj metodiky statistického inventarizačního šetření, na jejímž principu dnes stojí řešení většiny jeho výzkumných projektů. Pro potřeby inventarizací lesa IFER také vyvinul a neustále zdokonaluje komplexní technologii určenou pro sběr dat v terénu a jejich následné zpracování – Field-Map.